大部分植物的线粒体基因组由不同比例的环装DNA分子和线性DNA分子组成，呈环形排列。植物细胞中的线粒体拷贝数要远少于动物细胞。植物线粒体基因组最明显的特征就是物种之间呈现高度的多样化，基因组大小、结构等都存在很大差异。植物线粒体基因组大小跨度很大（kb~2.9Mb），但蛋白质编码基因数量则在30~70个（参考《植物基因组》，樊龙江主编）。
长期以来由于植物线粒体基因组的高复杂性、高变异性、低含量以及测序技术的缺陷等因素导致植物线粒体基因组研究严重滞后于植物叶绿体基因组，甚至已公开的线粒体基因组数量可能还没有植物核基因组数量多。NCBI目前收录的植物线粒体全长基因组大约有~多个（年12月31日仅收录条植物线粒体基因组）。
为解决植物线粒体基因组研究过程中的痛点，我们从样品提取、测序建库优化以及数据组装优化等多方面入手，构建了较为完善的植物线粒体基因组测序组装流程。成功完成了多个类群的植物线粒体基因组组装。大小从20K~3Mb的物种均成功获得完整线粒体基因组。
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